木瓜酶可以在餅干生產中的得到運用。除木瓜酶外，其它蛋白質水解酶也有助于餅干的生產。

生產硬餅干，宜用低蛋白含量的小麥面粉（WHEANT FLOUR）。這種低面筋指標的“軟”面粉需要加的水要少一些才能得到一個較理想的揉性。由“硬”面粉制成的生面團，在滾輾和磋打時會趨于蜷縮，導致成品也有一定程度的皺紋，結構粗糙。

將“木瓜酶”加入生面團中，可使面筋降解，生面團被軟化后易于加工。加入的酶量決定于放置的時間。生面團必須在加酶后15分鐘內烘烤。酶的濃度太高或者放置的時間太長，都會使生面團的水分變多。

?除了增進產品的質量外，使用木瓜酶還能減少對生面團必須的滾輾磋打，節約能源。

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